Mapping the mycobiome

Inleiding

Het overkoepelende doel van dit project is om experimenteel een innovatieve detectiemethode te ontwikkelen en te valideren die de rol van het mycobiome in de gastro-intestinale gezondheid en ziekte verkent.

Projectinformatie

• Projectacroniem: MYCOMAP.

Korte-termijn doelstellingen

De korte-termijn doelstellingen en resultaten van het project zijn:

1. Het opzetten van een experimentele methode voor de detectie van een unieke mycobiome samenstelling met behulp van een nieuw gegenereerde ITS-1 sequencing tool pipeline.
2. Het valideren van deze detectiemethode in ratmodellen met functionele darmstoornissen en hun respectieve controles.
3. Het valideren van deze pipeline in menselijke monsters afkomstig van cohorten met functionele darmstoornissen en controles.
4. Het valoriseren van dit detectiesysteem en het implementeren in de Gut-Research technologieportefeuille, als een reagent-test voor schimmelgerelateerde ziektebeelden.

Hoofduitkomst

De belangrijkste projectresultaat is het implementeren van een gevalideerde methode voor het in kaart brengen van het darm-mycobiome via een bioinformatica-analyse pipeline, met een goed begrijpelijke presentatie van de uitkomsten voor het algemene publiek. Aan het einde van het project zal deze methode worden gevaloriseerd en geëxploiteerd door Gut Research BV en geïmplementeerd in potentiële anti-schimmeltherapeutische strategieën in nauwe samenwerking met (medische) voeding en/of farmaceutische bedrijven. We streven ernaar om interacties te benutten via de mycobiome detectiemethode en nieuw verzameld intellectueel eigendom.

Lange-termijn doelstelling

De lange-termijn doelstelling van het project is om het darm-mycobiome te verhelderen dat bijdraagt aan de progressie van schimmelgerelateerde ziekten en de cruciale rol ervan in het behouden van gezondheid en het voorkomen van ziekte. De experimentele ontwikkeling van een gevalideerde detectiemethode in relevante diermodellen zal de huidige kennis over het microbieel ecosysteem en de interacties met verschillende biomen in de pathogenese van ziekten uitbreiden en bijdragen aan de ontwikkeling van nieuwe therapeutische strategieën. Momenteel ontbreken mycobiome-gegevens en de methode om deze vast te stellen doorgaans in preklinische instellingen, wat de zeer innovatieve aard van deze aanpak benadrukt.

Innovatie

Daarom zal dit darm-mycobiome concept veelbelovend en uniek zijn in Nederland.