Cloudplatform for High Content Imaging

Core Life Analytics ontwikkelt een cloudplatform voor onafhankelijke onderzoekers om snel en kosteneffectief HC data-analyse uit te voeren.

Subsidie
€ 20.000
2023

Projectdetails

Inleiding

Voor individuele onafhankelijke onderzoekswetenschappers is data-analyse altijd een lastig onderdeel waarvoor je vrijwel altijd een gespecialiseerde data scientist en/of een bio-informaticus nodig hebt. De huidige aanpak is nu erg technisch en vereist het combineren van meerdere niet-geïntegreerde softwarepakketten. Hierdoor wordt de snelheid van ontdekkingen van geneesmiddelen en doelwitten enorm belemmerd.

Doel van het project

Core Life Analytics wil een geïntegreerd cloudplatform ontwikkelen waarmee een individuele onderzoeker zijn HC data-analyse zonder hulp snel en kosteneffectief kan uitvoeren. Hiermee kan de vertaling van ruwe biologische beelden naar biologische kennis worden versneld.

Daarnaast wordt de onderzoekskosten significant verlaagd door:

  • Kortere doorlooptijden
  • Lagere kosten

Functionaliteiten van het platform

Binnen het platform kunnen onderzoekers naast de beeldanalyse van Core Life Analytics ook gebruikmaken van analysesoftware van third-party vendors.

Met dit cloudplatform hebben individuele biologen toegang tot alle reken- en analysehulpmiddelen die ze nodig hebben om hun ontdekkingsprojecten van het begin (onbewerkte gegevens, onbewerkte beelden) tot het einde (verwerkte gegevens en biologische inzichten) individueel uit te voeren.

Proces en doorlooptijd

Elke stap in het proces (microscopie – upload – beeldanalyse – data-analyse) kost 1 tot 4 dagen, waardoor de totale doorlooptijd van de pipeline bij hoge resolutie vaak ongeveer twee weken bedraagt.

In een groot deel van de analyses worden er in de dataverzameling fouten gemaakt die leiden tot niet-eenduidige resultaten. Het wijzigen van een eenvoudige contrastwaarde tijdens de microscopie kan bijvoorbeeld al leiden tot volledig afwijkende resultaten die lastig te verklaren zijn.

Kwaliteitsborging

Om dit te ondervangen wil CLA in het cloudplatform de traceability van alle processtappen waarborgen en meerdere validaties in het proces uitvoeren. Hierdoor wordt bewust of onbewust ‘human bias’ uitgesloten.

Financiële details & Tijdlijn

Financiële details

Subsidiebedrag€ 20.000
Totale projectbegroting€ 61.000

Tijdlijn

Startdatum5-4-2023
Einddatum31-12-2023
Subsidiejaar2023

Partners & Locaties

Projectpartners

  • Core Life Analytics B.V.penvoerder

Land(en)

Netherlands

Vergelijkbare projecten binnen MIT Haalbaarheid

Mkb-innovati...

Platform for parallelized biological tests

BI/OND ontwikkelt een gebruiksvriendelijke interface voor geautomatiseerde en parallelle tests met organ-on-a-chip technologie om gepersonaliseerde medicijnen te bevorderen en dierenproeven te verminderen.

€ 20.000
Mkb-innovati...

Privacy Enabling Technologies for a DNA-Platform (PET-DNA)

OASYS NOW ontwikkelt een softwareplatform dat DNA-data veilig beheert via blockchain, zodat individuen controle hebben over hun gegevens en kunnen deelnemen aan onderzoek met financiële beloning.

€ 20.000
Mkb-innovati...

Personalized PostYourLab

Labonovum ontwikkelt met het PostYourLab platform een gepersonaliseerd gezondheidsprofiel met AI-analyse van bloedtesten, gericht op betere inzichten en efficiëntere artsconsulten.

€ 20.000
Mkb-innovati...

HAALBAARHEID DIGITALISERING BODEMBIOLOGIE ANALYSES

Datacadabra ontwikkelt een AI-gestuurde applicatie voor snelle, efficiënte en goedkope biologische bodemanalyses, met cloud-gebaseerde aggregatie van gegevens voor wereldwijde trendanalyses.

€ 20.000
Mkb-innovati...

Onderzoeken haalbaarheid vernieuwing Ancora Health Platform

Ancora ontwikkelt een geautomatiseerd platform voor persoonlijk leefstijladvies op basis van biomarker-analyse en fysieke testen, in samenwerking met UMCG, om handmatige processen te verminderen.

€ 20.000

Vergelijkbare projecten uit andere regelingen

ERC Proof of...

Streamlining structural biology: Developing a high-throughput cloud-based cryo-electron tomography platform

Develop a cloud-based workflow for automated high-throughput cryo-electron tomography data analysis to democratize access and reduce processing time, enhancing molecular research.

€ 150.000
EIC Accelerator

Closed-loop deep learning in early-stage drug discovery - cloud platform for targeted protein degradation

Celeris Therapeutics leverages deep learning to develop a web platform for degrading undruggable proteins, aiming to revolutionize drug discovery for incurable diseases like Alzheimer's and cancer.

€ 2.500.000
EIC Accelerator

Multi-omic data driven drug discovery and indication prioritisation platform in oncology

mCUBE is an AI-driven platform aimed at enhancing precision oncology by harmonizing clinical data and multi-omic analysis to identify new drug candidates for licensing to pharma companies.

€ 2.495.788
ERC Proof of...

AI Organoid Image Analysis

Developing a user-friendly SaaS toolbox utilizing AI for automated quantification of organoid images to enhance accuracy, standardization, and efficiency in organoid research.

€ 150.000
ERC Starting...

Commoditizing Data Analytics in the Cloud

Develop an open, cost-efficient cloud analytics database, CODAC, to reduce query costs and enable seamless data migration across platforms, enhancing large-scale data analytics accessibility.

€ 1.498.125